Menetelmiä

Menetelmiä

kimmo.porkka - 28.05.2010 - 06:39
Viimeksi muokannut: 
kimmo.porkka - 09.10.2018 - 10:50

Antigeenireseptorigeeni

Antigeenireseptorigeeni

kimmo.porkka - 28.05.2010 - 06:54

Käyttöaiheita

  • Lymfaattisten maligniteettien (leukemiat, lymfoomat) diagnoosivaihe ja jäännöstautiseuranta

Tutkimusnimikkeitä

TYKS

Diagnoosivaiheessa
  • 11828 Bm-ASOAL-D Immunoglobuliini ja TCR-geenit, ASO-PCR 2 klooniin, luuytimestä
  • 11827 B-ASOAL-D Immunoglobuliini ja TCR-geenit, ASO-PCR 2 klooniin, verestä
Kvantitatiivinen molekulaarinen jäännöstautianalyysi seurantanäytteestä
  • 12507 Bm-ASO2-QD Jäännöstautianalyysi kahteen Ig/TCR kohteeseen (kvant.), luuytimestä
  • 12508 B-ASO2-QD Jäännöstautianalyysi kahteen Ig/TCR kohteeseen (kvant.), verestä

HUSLAB

  • 3905 Bm-TCR-D T-solureseptorigeenin uudelleenjärjestymätutkimus, luuytimestä
  • 3904 B -TCR-D T-solureseptorigeenin uudelleenjärjestymätutkimus, verestä

ISLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

TaYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

OYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

SHR

  • (tallennettavien muuttujien nimiä)

Tulkinnnassa huomioon otettavaa

  • (txt)
Kirjoittajat:  nimet
Viimeisin päivitys: pvm
© Suomen Hematologiyhdistys Suomen Leukemiaryhmä

 

Viimeksi muokannut: 
kimmo.porkka - 09.10.2018 - 10:51

BCR-ABL1

BCR-ABL1

kimmo.porkka - 31.05.2010 - 08:30

Käyttöaiheita

  • BCR-ABL1-fuusiogeenipositiivisten tautien (KML, Ph+ALL) diagnostiikka ja jäännöstaudin seuranta

Raportointi

  • Tulokset ilmoitetaan KML:n jäännöstautitutkimuksissa IS-prosenttiasteikolla
  • SHR:ssa negatiivinen arvo merkitään muuttujaan b-bcr-qr-is lyhenteellä "neg" ja taudin tilanteeksi (status-cml) merkitään CMR (complete molecular response)
  • Negatiivisen tuloksen yhteydessä on aina ilmoitettava myös saavutettu herkkyys; negatiivinen tulos voidaan ilmoittaa vain, jos jos näytteen herkkyys on ollut riittävä (raja-arvo 0,01%/-4,0 log/MR4)
  • Herkkyys tallennetaan prosenttiarvona potilaskohtaiseen SHR-avainmuuttujaan b-bcr-qr-sens (Veren BCR-QR -tutkimuksen näytekohtainen herkkyystaso).
  • Mikäli negatiiviseksi ilmoitetun näytteen herkkyys on >0,01%(MR4), näyte on tulkittava huonolaatuiseksi. Taudin tilannearviota (status-cml) ei voida tehdä. Tällöin muuttujaan b-bcr-qr-is arvo merkitään lyhenteellä "ne" (not evaluable)

Tutkimusnimikkeitä
 

TYKS

KML-potilailla (jäännöstautitulos IS-asteikolla)
  • 12138 B-CMLPCR Kroonisen myeloisen leukemian kvantitatiivinen jäännöstautianalyysi verestä
Ph+ ALL-potilailla (jäännöstautituloksen standardina potilaan oma diagnoosivaiheen näyte)
  • 4894 B-BCR-QR BCR-ABL-geenien fuusio-RNA: t(9:22), kvantitatiivinen jäännöstautianalyysi verestä
  • 4895 Bm-BCR-QR BCR-ABL-geenien fuusio-RNA: t(9:22), kvantitatiivinen jäännöstautianalyysi luuytimestä

HUSLAB

  • 21252 B-KML-Qr BCR/ABL-geenien fuusiotranskriptin määritys: t(9:22), kvantitatiivinen, verestä, KML-seuranta
  • 4895 Bm-BCR-QR BCR/ABL-geenien fuusiotranskriptin määritys: t(9:22), kvantitatiivinen, luuytimestä, Ph+ALL- seuranta

ISLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

Fimlab

NordLab

  • 4894 B-BCR-Qr BCR/ABL-geenien fuusio-RNA: t(9:22), kvantitatiivinen, verestä
  • 4895 Bm-BCR-Qr BCR/ABL-geenien fuusio-RNA: t(9:22), kvantitatiivinen, luuytimestä

SHR

  • b-bcr-qr-is, b-bcr-qr-sens

 

Kirjoittajat:  Kimmo Porkka, Perttu Koskenvesa, Veli Kairisto
Viimeisin päivitys: 18.11.2010
© Suomen Hematologiyhdistys Suomen Leukemiaryhmä

 

Viimeksi muokannut: 
kimmo.porkka - 09.10.2018 - 10:51

IS-standardi

IS-standardi

hallinta - 31.05.2010 - 08:35

BCR-ABL1-transkriptiarvojen raportoinnissa käytetään KML:ssä International Scale (IS) -asteikkoa.

Tuloksen ilmoittaminen IS-asteikolla vaatii laboratoriolta standardointikierrosten avulla lasketun korjauskertoimen säännöllistä päivittämistä.  FIMLAB käyttää Ipsogenin systeemiä, jossa on plasmidistandardi ja kittikohtainen IS- kalibraatioarvo tuloksen ilmoittamiseksi IS- asteikolla.

Vanhat log-arvot vertautuvat prosenttilukuihin oheisen taulukon ja kaavakuvan mukaisesti (ei tarkka muutos, menetelmäriippuvainen).

MR3 ≤ 0.1%, MR4 ≤ 0.01%, MR4.5 ≤ 0.0032%, MR5 ≤ 0.001%

Viimeksi muokannut: 
kimmo.porkka - 09.10.2018 - 10:51

CEBPA

CEBPA

kimmo.porkka - 01.11.2010 - 05:18

Käyttöaiheita

  • Akuutin leukemian diagnostiikka ja jäännöstaudin seuranta

Raportointi

  • Tulokset ilmoitetaan prosenttilukuna suhteutettuna kontrolligeenin ilmentymään
  • Negatiivinen tulos ilmoitetaan arvolla 0,0001% (=-6 log). SHR:ssa negatiivinen arvo merkitään lyhenteellä "neg". Negatiivisen tuloksen yhteydessä on aina ilmoitettava myös saavutettu herkkyys; negatiivinen tulos voidaan ilmoittaa vain, jos jos näytteen herkkyys on ollut riittävä (raja-arvo x.xx). 

Tutkimusnimikkeitä

TYKSLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

HUSLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

ISLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

TaYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

OYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

SHR

  • (tallennettavien muuttujien nimiä)

Tulkinnnassa huomioon otettavaa

  • (txt)
Kirjoittajat:  Kimmo Porkka
Viimeisin päivitys: 31.05.2010
© Suomen Hematologiyhdistys Suomen Leukemiaryhmä

 

Viimeksi muokannut: 
kimmo.porkka - 09.10.2018 - 10:51

FLT3

FLT3

hallinta - 01.11.2010 - 05:11

Käyttöaiheita

  • Akuutin leukemian diagnostiikka ja jäännöstaudin seuranta

Raportointi

  • Tulokset ilmoitetaan prosenttilukuna suhteutettuna kontrolligeenin ilmentymään
  • Negatiivinen tulos ilmoitetaan arvolla 0,0001% (=-6 log). SHR:ssa negatiivinen arvo merkitään lyhenteellä "neg". Negatiivisen tuloksen yhteydessä on aina ilmoitettava myös saavutettu herkkyys; negatiivinen tulos voidaan ilmoittaa vain, jos jos näytteen herkkyys on ollut riittävä (raja-arvo x.xx). 

Tutkimusnimikkeitä

TYKS

Diagnoosivaiheen näytteestä

Kvantitatiivinen jäännöstautianalyysi seurantanäytteestä

  • 12487 Bm-FLT3-QD  FLT3-geenin kvantitatiivinen mutaatioanalyysi, luuytimestä
  • 12486 B-FLT3-QD   FLT3-geenin kvantitatiivinen mutaatioanalyysi, verestä

HUSLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

ISLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

TaYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

OYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

SHR

  • (tallennettavien muuttujien nimiä)

Tulkinnnassa huomioon otettavaa

  • (txt)
Kirjoittajat:  Kimmo Porkka
Viimeisin päivitys: 31.05.2010
© Suomen Hematologiyhdistys Suomen Leukemiaryhmä

 

Viimeksi muokannut: 
kimmo.porkka - 09.10.2018 - 10:52

Fuusiogeeniseulonta

Fuusiogeeniseulonta

kimmo.porkka - 03.06.2010 - 21:29

Käyttöaiheita

  • Akuutin leukemian diagnostiikka 

Raportointi

  • Tulokset ilmoitetaan lausuntomuotoisena  

Tutkimusnimikkeitä

TYKS

HUSLAB

ISLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

TaYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

OYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

SHR

  • (tallennettavien muuttujien nimiä)

Tulkinnnassa huomioon otettavaa

  • (txt)
Kirjoittajat:  Kimmo Porkka
Viimeisin päivitys: 31.05.2010
© Suomen Hematologiyhdistys Suomen Leukemiaryhmä

 

Viimeksi muokannut: 
kimmo.porkka - 09.10.2018 - 10:52

JAK2

JAK2

kimmo.porkka - 16.06.2010 - 17:24

Käyttöaiheita

  • (teksti)

Tutkimusnimikkeitä

TYKS

Myeloproliferatiivisen taudin diagnostiikka

HUSLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

ISLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

TaYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

OYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

SHR

  • (tallennettavien muuttujien nimiä)

Tulkinnnassa huomioon otettavaa

  • (txt)
Kirjoittajat:  Kimmo Porkka
Viimeisin päivitys: 31.05.2010
© Suomen Hematologiyhdistys Suomen Leukemiaryhmä
Viimeksi muokannut: 
kimmo.porkka - 09.10.2018 - 10:53

NPM1

NPM1

hallinta - 19.09.2010 - 23:32

Käyttöaiheita

  • Akuutin leukemian ja MDS:n diagnostiikka ja jäännöstaudin seuranta

Tutkimusnimikkeitä

TYKS

HUSLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

ISLAB

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

TaYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

OYS

  • (nimike ja linkki ohjekirjaan)

SHR

  • (tallennettavien muuttujien nimiä)

Tulkinnnassa huomioon otettavaa

  • (txt)
Kirjoittajat:  Kimmo Porkka
Viimeisin päivitys: 31.05.2010
© Suomen Hematologiyhdistys Suomen Leukemiaryhmä
Viimeksi muokannut: 
kimmo.porkka - 09.10.2018 - 10:53